由于高光譜遙感在地面目標識別方面的優勢，很早就被應用于軍事領域并且逐步取代多光譜遙感成為主要偵察手段。本文主要介紹了高光譜遙感在軍事方面的應用。

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1. 戰場詳細偵察

高光譜遙感儀器能夠在連續的工作波段上同時對目標進行探測，可以直接反應被測的物體的光譜特征，能夠分辨出目標表面成分和狀態，可以得到空間探測信息與地面實際目標之間存在的精確對應關系。

以色列的科學家利用CASI高光譜成像光譜儀在特拉維夫市進行了研究，從CASI圖像中選擇典型的地物作為端元數據，對河流、沙土、植被等地物都取得了很好的識別效果。

美國海軍設計的高光譜成像儀，可在0.4~2.5m光譜范圍內提供210個波段的光譜數據，可獲得近海環境目標的動態特性，例如海水的透明度、海洋深度、海流、海底特征、水下危險物、油泄漏等成像數據，為海軍近海作戰提供參考美國提出了數字化地球研究目標是建立全球地表每平方米的數據庫包括目標和背景特征光譜在內的多種參數.數據庫建立以后，全球任何地方的軍事目標都會處于其監控和打擊之下。

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2. 識別偽裝目標

在軍事目標偵察、識別偽裝方面，高光譜遙感能夠依據背景與偽裝目標不同的光譜特性發現軍事裝備通過光譜特征曲線可反演出目標的組成成分從而揭露與背景環境不同的目標及其偽裝綠色偽裝材料檢測的一個重要手段就是利用植物的紅邊效應植被在680~720nm反射率升高通過檢測其位置和斜率的特征就可以識別植被的種類和狀態。

現有綠色偽裝材料的光譜曲線大體上可以與植被相吻合在多光譜偵察條件下能夠滿足偽裝要求但是在高光譜細微的分辨能力下經過偽裝的目標便無所遁形劉凱龍等以植被的紅邊作為基本識別特征識別準確率達到了99%。

3. 機載高光譜設備

Elbit系統公司最近推出的Hermes 450和Hermes 900無人機系統UAS. 高光譜有效載荷擴展了其有效載荷系列，新研發的兩種有效載荷具有創新的情報能力。這項獨特、新穎的高光譜成像技術是基于Elbit系統公司的下屬Electro-0ptics Elop公司的專項研究，能使不同波長的影像同時成像。其獨特的有效載荷能夠使自然界所有材料的光譜信號成像，就像指紋成像一樣。這種非常敏感的成像技術可以在較寬的光譜范圍和極高的分辨率下區分大多數顏色來進行遙感作業。

這種機載高光譜系統可用來識別、測量和跟蹤各種材料和物體，包括發現弱信號軍事活動和暗藏障礙物，以及識別危險品。作為補充，它配有一個可提供自動成像/數據翻譯和任務規劃系統的地面設施。

Hermes 450和Hermes 900無人機系統UAS. 的配置使該技術很容易在各種情況下發揮遙感和監測能力。